据大公报报道  海口综合保税区设立后，将与洋浦保税港区在产业定位上错位布局，互为补充，统筹发展。

海口综合保税区设立后，将充分发挥依托省会城市，即海口被批准为内地加工贸易梯度转移承接城市的优势，重点发展具有海南特色的、轻型的外向型加工业。如：承接梯度转移的无污染加工业，为海南旅游业和会展业服务的保税物流业，“两头在外”的高新技术产业等。

海南洋浦保税港区是华南第一、内地第四个国家级保税港区，一期已于2008年10月13日顺利通过国家验收，2008年11月20日正式开港运作。该区将努力打造成为面向东南亚的航运枢纽、物流中心和出口加工基地，重点发展能源、原材料等大宗物流业务和石油化工等产业。

海口综合保税区和洋浦保税港区同时作为海南扩大开发的重要载体，在产业定位上实行错位布局，互为补充。业内人士指出，洋浦保税港区和海口综合保税区相继在海南设立，这是中央对海南的重视，为海南构建特色产业结构和更具活力的体制机制带来了难得机遇。