岛内交通部门已对高雄港未来发展定位为物流港，为推动高雄港发展物流加值业务，目前高雄港发展面临港区土地严重不足的问题，港区内已无多余的空间拓展物流相关业务，高雄港务局有鉴于此，除在近年内办理洲际货柜中心第一期工程及第二货柜中心后方土地取得，以增加港区发展空间，并为因应业务成长及高雄港未来发展之需求，宜尽早推动洲际货柜中心第二期工程计画。

高雄港务局指出，由于第二期工程计画执行期程可能长达10年，因待日后港区空间不足时方开始兴建，恐缓不济急，是以洲际计画第二期工程仍应尽快推动，以兴建具备深水货柜码头之新式货柜基地，提供大型货柜船之靠泊，以及迁移旧港区石化码头，减低对邻近市区之工安威胁，且高雄港须俟完成洲际计画第二期工程后，方有内、外港功能调整的空间。

高雄港洲际货柜中心一期工程计画系在亚太地区港口日益激烈的竞争环境及货柜船大型化的趋势而准备，不仅引进民间资金与企业经营理念、解决高雄港大型货柜船靠港问题、促进高雄港码头使用整合，更能增加航商的营运弹性与创造就会机会，高雄港务局表示，高雄港洲际货柜中心一期工程系依据「促进民间参与公共建设法」相关规定公开对外招标，已由高明货柜码头公司取得开发权利，并已于2007年12月31日动工，因此在多赢的利基下，实无暂缓兴建的考量。

对于日前大前研一先生指出：高雄港的深度不够，且停泊码头已呈现严重闲置的问题，因此建议洲际货柜中心第二期工程应暂缓执行，该局表示：高雄港目前二港口航道深度已达水深16公尺，各货柜码头水深亦达负14～负15公尺，已可供8,000TEU级货柜船进港靠泊。

由于高雄港各货柜码头非属公用码头，系采取出租方式提供各航商承租，各码头货柜船靠泊频率系由各航商根据其航线及业务的考量自行掌控，事实上目前货柜码头数量及能量，已不足以因应未来业务成长需要，加以受限于第二港口航道深度，10,000TEU级以上大型货柜船需以减载方式方得以入港；高雄港务局对此问题遂规划将深水货柜码头移往外海，以减少大型货柜船通行的限制，作为争取大型货柜船靠泊的条件。

此外，由于金融海啸所引发的全球不景气现象，对全球各主要港口货柜运量均已产生严重的影响，高雄港在此一影响下货柜运量及货柜船靠泊次数确有减少，然而对未来的发展，仍应以逐年向上发展趋势加以妥为因应。