深圳海关还致力加强大通关建设，不断优化通关软环境。一是延长口岸通关时间，解决高峰期人流、车流的疏导问题。至2007年，罗湖口岸通关时间延长到凌晨零时，皇岗口岸、深圳湾口岸均已实行24小时通关。二是积极投入新口岸建设，进一步提高深圳公路和海运口岸的通关能力。2007年7月1日，深圳湾口岸作为香港回归十周年重要献礼而顺利开通；连接深圳福田与皇岗落马洲支线的福田地铁口岸也在2007年8月15日开通；深圳西部又一集装箱大港——大铲湾海关的开关也在紧锣密鼓地筹备中。三是采取多项措施促深圳经济发展。深圳海关先后出台实施了「九项措施，八项承诺」、「支持深圳市大型企业发展十项措施」、「支持深圳市实施自主创新战略建设国家创新型城市六项配套措施」等多个办法，全方位的为地方外向型经济发展保驾护航。同时加大地方电子口岸建设力度，推行网上支付、联网报关、上门验放、担保放行等多项优惠措施，实现企业电子化，提高通关效率，为深圳外贸出口超千亿美元作出积极贡献。

改革开放成就了深圳海关，使它由一个边陲小关壮大成为「大关」和「强关」——深圳海关业已成为浓缩中国海关改革开放历史的绚丽篇章，并将继续书写辉煌！