肯尼亚交通部部长希劳·马克韦雷(Chirau MWAKWERE)在4月19日庆祝肯尼亚港务局成立30周年庆典仪式上说，耗资200亿肯先令（约合3.2亿美元）的蒙巴萨港口扩建和第二期集装箱码头工程将于2011年竣工。

肯尼亚政府出资40亿肯先令修建蒙巴萨港口扩建工程，第二期集装箱码头工程所需的160亿肯先令来自日本援款。

目前，由于水道深度不够，蒙巴萨港口只能停靠中等吃水的船只。船只滞港压力也很大，平均每艘船要等待10天才能卸货。扩建工程将加宽加深水道、增加港口设施，提高港口的吞吐量。

2007年，蒙巴萨港口吞吐量为1590万吨，比2006年的1440万吨增长了10.5％。