万吨级深水泊位建成后，虎门港将建设口岸集中查验设施。记者从黄埔海关沙田办事处获悉，目前虎门港口岸查验配套设施已经进入规划阶段，建成后这一新的通关模式将极大地节约企业通关时间和成本。 

据预计，包括万吨级深水泊位在内的虎门港一系列主体工程将于2008年8月左右初步建成。为了满足建成后虎门港进出口物流需要，东莞市联合海关、口岸、检验检疫、海事、边检等相关单位开始对虎门港口岸查验配套设施进行规划。 

根据三份设计方案，均采用在西大坦、新沙南、立沙岛三大作业区各建设一个口岸集中查验区的方式。根据设计院的推荐方案，拟在西大坦5号、6号泊位与保税物流园之间建设集中查验区，将海关、检验检疫、海事、边检等相关口岸单位全部纳入其中，并将通过建地下隧道等方式，使物流园与查验区实现无缝接驳。