为了加强码头的反恐、反偷渡及反盗窃措施，蛇口集装箱码头斥巨资在码头进出闸的行政通道及工程部的侧门安装了先进的双辊闸门禁系统，并于4月18日开始投入使用。这是蛇口集装箱码头为履行《国际船舶及港口设施保安规则》的又一项措施，它的使用必将大大提高码头对其货物及人员的安全保卫能力，同时也将有效的预防及打击恐怖分子、偷渡客及不法盗窃分子利用码头进行的非法活动。

蛇口集装箱码头是深圳市第一家国际集装箱码头，现有泊位7个，设计能力超过450万标准箱，是珠江三角洲地区货物进行口最主要的通道之一。目前，每天进行码头闸口的车辆约达三千多辆。