3月21日，福州海关联手厦门海关，再推简化两岸直航船舶申报手续的新措施。手续简化后，两岸直航船舶通常情况下只需提交原规定中的3份单证即可办理申报手续。  

由于三条航线每月固定往返航班多达780班次，每艘船舶每月往返少则20班次，多则100班次。承运直航的船公司和船代公司反映，每航次一报，申报次数频繁，且内容相同，重复率高。 

简化手续后，两岸直航船舶通常情况下只需向海关提交《总申报单》、《船员物品申报单》、《旅客名单》3份申报单据，遇有承载货物、船舶物品和船员变动时，才需要提供相应的《货物申报单》、《船舶物品申报单》、《船员名单》。