2006年，马鞍山港货物吞吐量接近2400万吨，再次创下历史新高。 

随着港口体制改革的逐步完善，港口行政管理部门依法监督管理的力度加强，为港口企业、码头单位创造良好的港口经营环境。有些港口企业对原有的码头改扩建和装卸机械设备更新，以及新增了一些港口企业(码头)，这大大地提高了港口的通过能力。城市的经济发展带动港口吞吐量的增加，特别是马钢、山鹰等企业的快速发展给港口带来充足的货源。港口正朝着打造物流集散地发展，成为拉动我市经济发展的重要推动力量。截至2006年12月31日，马鞍山港共完成货物吞吐量2391.1万吨，其中外贸吞吐量33.5万吨，集装箱吞吐量48209标箱，分别比去年同期增长19.0%、42.5%和30.0%。