福建“十一五”期间将会投资297亿元振兴港口经济，投资额是“十五”的近5倍，重点发展厦门港、福州港和湄洲湾港。

福建省省长黄小晶表示，福建正力争到2010年使港口通过能力超过3亿吨，2020年达到6亿吨，基本建成海峡西岸港口群，成为我国内地最便捷的对台信道和出海信道。
根据福建的“十一五”港口建设规划，厦门港要建成以集装箱干线运输为主的国内主要港口，并逐步向国际中转港方向发展。福州港会着力开发外海深水港区，逐步发展成为干散货运输与集装箱运输并重的国内主要港口。湄洲湾南北两岸要整合成为一个完整的港口，逐步发展成以液体散货运输为主的枢纽中心。

与此同时，福建还提出统筹规划加快建设海上运输大通道，重点建设集装箱、煤炭矿石、油气化工和工业港区四大港口运输系统，集中建设发展东渡、海沧、嵩屿、招银、江阴、罗源湾、湄洲湾、三都澳等110个沿海港口深水泊位，配套建设厦门港20万吨级、福州港罗源湾港区30万吨级、江阴港区20万吨级、湄洲湾10万吨级、宁德港30万吨级航道等一批大型深水航道。